卷八十四 志第六十 河渠二
卷八十四 志第六十 河渠二
黄河下
黄河（下）
万历元年，河决房村，筑堤□子头至秦沟口。明年，给事中郑岳言：「运道自茶城至淮安五百余里，自嘉靖四十四年河水大发，淮口出水之际，海沙渐淤，今且高与山等。自淮而上，河流不迅，泥水愈淤。于是邳州浅，房村决，吕、梁二洪平，茶城倒流，皆坐此也。今不治海口之沙，乃日筑徐、沛间堤岸，桃、宿而下，听其所之。民之为鱼，未有已时也。」因献宋李公义、王令图浚川爬法。命河臣勘奏，从其所言。而是年秋，淮、河并溢。明年八月河决砀山及邵家口、曹家庄、韩登家口而北，淮亦决高家堰而东，徐、邳、淮南北漂没千里。自此桃、清上下河道淤塞，漕艘梗阻者数年，淮、扬多水患矣。总河都御史傅希挚改筑砀山月堤，暂留三口为泄水之路。其冬，并塞之。
万历元年，黄河在房村决口，修筑了从□子头到秦沟口的堤坝。第二年，给事中郑岳上奏说：“运道从茶城到淮安有五百多里，自从嘉靖四十四年黄河大水，淮河口出水的地方，海沙逐渐淤积，现在几乎高得像山一样。从淮河往上，河流流速不快，泥沙更加淤积。于是邳州水浅，房村决口，吕梁、徐州二洪水平缓，茶城出现倒流，都是因为这个原因。如今不治理海口的泥沙，却天天修筑徐州、沛县之间的堤岸，桃源、宿迁以下，任凭河水泛滥。百姓成为鱼鳖，没有尽头。”于是进献了宋代李公义、王令图的浚川爬法。皇帝命令河臣勘察上奏，采纳了他的建议。但当年秋天，淮河和黄河同时泛滥。第二年八月，黄河在砀山以及邵家口、曹家庄、韩登家口决口向北流，淮河也在高家堰决口向东流，徐州、邳州、淮河南北淹没千里。从此以后，桃源、清河上下游河道淤塞，漕运船只被阻断了数年，淮安、扬州一带水患频繁。总河都御史傅希挚改筑了砀山的月堤，暂时留下三个决口作为泄水通道。当年冬天，将这些决口一并堵塞。
四年二月，督漕侍郎吴桂芒言：「淮、扬洪潦奔冲，盖缘海宾汊港久堙，入海止云梯一径，致海拥横沙，河流泛溢，而盐、安、高、宝不可收拾。国家转运，惟知急漕，而不暇急漕，而不暇急民，故朝廷设官，亦主治河，而不知治海。请设水利佥事一员，专疏海道，审度地利，如草湾及老黄河皆可趋海，何必专事云梯哉？」帝优诏报可。
万历四年二月，督漕侍郎吴桂芒上奏说：“淮安、扬州一带洪水奔涌，是因为海边支流港汊长期淤塞，入海只有云梯关一条通道，导致海水拥塞横沙，河流泛滥，而盐城、安东、高邮、宝应等地无法收拾。国家转运物资，只知道急于漕运，却顾不上百姓，所以朝廷设置的官员，也主要治理黄河，而不知道治理海口。请求设立一名水利佥事，专门负责疏通海道，审度地理形势，比如草湾和老黄河都可以通向大海，何必只依赖云梯关呢？”皇帝下诏优厚地答复并批准了他的建议。
桂芳复言：「黄水抵清河与淮合流，经清江浦外河，东至草湾，又折而西南，过淮安、新城外河，转入安东县前，直下云梯关入海。近年关口多壅，河流日浅，惟草湾地低下，黄河冲决，骎骎欲夺安东入海，以县治所关，屡决屡塞。去岁，草湾迤东自决一口，宜于决口之西开挑新口，以迎埽湾之溜，而于金城至五港岸筑堤束水。语云：「救一路哭，不当复计一家哭。」今淮、扬、凤、泗、邳、徐不啻一路矣。安东自众流汇围，只文庙、县署仅存椽瓦，其势垂陷，不如委之，以拯全淮。」帝不欲弃安东，而命开草湾如所请。八月，工竣，长万一千一百余丈，塞决口二十二，役夫四万四千。帝以海口开浚，水患渐平，赉桂芳等有差。
吴桂芳又说：“黄河水到达清河与淮河合流，经过清江浦的外河，向东到草湾，又折向西南，经过淮安、新城的外河，转入安东县前，直下云梯关入海。近年来关口多被堵塞，河流日渐变浅，只有草湾地势低下，黄河冲决，渐渐想要夺取安东入海的道路，但因为关系到县治，所以屡次决口又屡次堵塞。去年，草湾以东自己决开一个口子，应该在决口西边开挖新口，以迎接埽湾的水流，并在金城到五港的岸边筑堤束水。俗话说：‘救一路的哭，不应该再计较一家的哭。’如今淮安、扬州、凤阳、泗州、邳州、徐州不止一路了。安东被众流汇合包围，只有文庙、县署还存有椽瓦，形势快要陷落，不如放弃它，以拯救整个淮河地区。”皇帝不想放弃安东，但命令按照请求开挖草湾。八月，工程完工，长一万一千一百多丈，堵塞决口二十二处，役夫四万四千人。皇帝因为海口开通疏浚，水患逐渐平息，赏赐吴桂芳等人各有差别。
未几，河决韦家楼，又决沛县缕水堤，丰、曹二县长堤，丰、沛、徐州、睢宁、金乡、鱼台、单、曹田庐漂溺无算，河流啮宿迁城。帝从桂芳请，迁县治、筑土城避之。于是御史陈世宝请复老黄河故道，言：「河自桃源三义镇历清河县北，至大河口会淮入海。运道自淮安天妃庙乱淮而下，十里至大河口，从三义镇出口向桃源大河而去，凡七十余里，是为老黄河。至嘉靖初，三义镇口淤，而黄河改趋清河县南与淮会，自此运道不由大河口而径由清河北上矣。近者，崔镇屡决，河势渐趋故道。若仍开三义镇口引河入清河北，或令出大河口与淮流合，或从清河西别开一河，引淮出河上游，则运道无恐，而淮、泗之水不为黄流所涨。」部覆允行。
不久，黄河在韦家楼决口，又在沛县的缕水堤决口，丰县、曹县的长堤也决口，丰县、沛县、徐州、睢宁、金乡、鱼台、单县、曹县的农田房屋被淹没无数，河流冲刷宿迁城。皇帝听从吴桂芳的请求，迁移县治、修筑土城来躲避。于是御史陈世宝请求恢复老黄河的故道，说：“黄河从桃源的三义镇经过清河县北，到大河口会合淮河入海。运道从淮安的天妃庙横渡淮河而下，十里到大河口，从三义镇出口向桃源的大河而去，共七十多里，这就是老黄河。到嘉靖初年，三义镇口淤塞，黄河改道趋向清河县南与淮河会合，从此运道不经大河口而直接由清河县北上了。近来，崔镇屡次决口，河势逐渐趋向故道。如果仍然开挖三义镇口引河进入清河县北，或者让它从大河口与淮河合流，或者从清河县西另开一条河，引淮河从黄河上游流出，那么运道就没有危险，而淮河、泗水的水也不会被黄河水上涨所影响。”部里批复同意执行。
桂芳言：「淮水向经清河会黄河趋海。自去秋河决崔镇，清江正河淤淀，淮口梗塞。于是淮弱河强，不能夺草湾入海之途，而全淮南徙，横灌山阳、高、宝间，向来湖水不逾五尺，堤仅七尺，今堤加丈二，而水更过之。宜急护湖堤以杀水势。」部议以为必淮有所归，而后堤可保，请令桂芳等熟计。报可。
吴桂芳说：“淮水向来经过清河会合黄河奔向大海。自从去年秋天黄河在崔镇决口，清江的正河淤积沉淀，淮河口堵塞。于是淮水弱而黄河强，不能夺取草湾入海的通道，而整个淮水南移，横灌山阳、高邮、宝应之间，向来湖水不超过五尺，堤坝只有七尺，现在堤坝加高到一丈二尺，而水势更超过它。应该紧急保护湖堤来削减水势。”部里议论认为必须让淮水有所归宿，然后堤坝才能保住，请求命令吴桂芳等人仔细筹划。皇帝批复同意。
开河、护堤二说未定，而河复决崔镇，宿、沛、清、桃两岸多坏，黄河日淤垫，淮水为河所迫，徙而南，时五年八月也。希挚议塞决口，束水归漕。桂芳欲冲刷成河，以为老黄河入海之路。帝令急塞决口，而俟水势稍定，乃从桂芳言。时给事中汤聘尹议导淮入江以避黄，会桂芳言：「黄水向老黄河故道而去，下奔如驶，淮遂乘虚涌入清口故道，淮、扬水势渐消。」部议行勘，以河、淮既合，乃寝其议。
开河和护堤两种说法尚未确定，而黄河又在崔镇决口，宿迁、沛县、清河、桃源两岸多处损坏，黄河日益淤积垫高，淮水被黄河所迫，向南迁徙，这时是万历五年八月。傅希挚建议堵塞决口，约束河水归入漕渠。吴桂芳想要冲刷成河，作为老黄河入海的通道。皇帝命令紧急堵塞决口，等水势稍定，再听从吴桂芳的建议。当时给事中汤聘尹建议引导淮水进入长江以避开黄河，恰逢吴桂芳说：“黄河水向老黄河故道流去，向下奔流如飞，淮水于是乘虚涌入清口故道，淮安、扬州的水势逐渐消退。”部里议论进行勘察，因为黄河和淮水已经合流，于是搁置了这个建议。
管理南河工部郎中施天麟言：
管理南河的工部郎中施天麟上奏说：
「淮、泗之水不下清口而下山阳，从黄浦口入海。浦口不能尽泄，浸淫高、宝邵伯诸湖，而湖堤尽没，则以淮、泗本不入湖，而今入湖故也。淮、泗之入湖者，又缘清口向未淤塞，而今淤塞故也。清口之淤塞者，又缘黄河淤塞日高，淮水不得不让河而南徙也。盖淮水并力敌黄，胜负或亦相半，自高家堰废坏，而清口内通济桥、朱家等口淮水内灌，于是淮、泗之力分，而黄河得以全力制其敝，此清口所以独淤于今岁也。下流既淤，则上流不得不决。
“淮河、泗水的水不从清口下泄而流到山阳，从黄浦口入海。黄浦口不能完全排泄，水势蔓延到高邮、宝应、邵伯等湖，而湖堤全部淹没，这是因为淮河、泗水本来不流入湖中，而现在流入湖中的缘故。淮河、泗水流入湖中，又是因为清口向来没有淤塞，而现在淤塞的缘故。清口的淤塞，又是因为黄河淤塞日益增高，淮水不得不让黄河而向南迁徙。大概淮水全力对抗黄河，胜负或许各半，自从高家堰废坏，而清口内的通济桥、朱家等口淮水向内灌注，于是淮河、泗水的力量分散，而黄河得以全力控制其弱点，这就是清口在今年独独淤塞的原因。下游既然淤塞，那么上游就不得不决口。
每岁粮艘以四五月毕运，而堤以六七月坏。水发之时不能为力，水落之后方图堵塞。甫及春初，运事又迫，仅完堤工，于河身无与。河身不挑则来年益高。上流之决，必及于徐、吕，而不止于邳、迁；下流之涸，将尽乎邳、迁，而不止于清、桃。须不惜一年粮运，不惜数万帑藏，开挑正河，宽限责成，乃为一劳永逸。
每年粮船在四五月间完成运输，而堤坝在六七月间损坏。水发的时候无法用力，水落之后才图谋堵塞。刚到春初，漕运事务又紧迫，只完成了堤坝工程，对河床本身没有作用。河床不疏浚，来年就会更高。上游的决口，一定会波及徐州、吕梁，而不止于邳州、宿迁；下游的干涸，将会遍及邳州、宿迁，而不止于清河、桃源。必须不惜一年的粮运，不惜数万国库钱财，开挖疏浚正河，放宽期限责成完成，才能一劳永逸。
至高家堰、朱家等口，宜及时筑塞，使淮、泗并力足以敌黄，则淮水之故道可复，高、宝之大患可减。若兴、盐海口堙塞，亦宜大加疏浚。而湖堤多建减水大闸，堤下多开支河。要未有不先黄河而可以治淮，亦未有不疏通淮水而可以固堤者也。」事下河漕诸臣会议。
至于高家堰、朱家等口，应该及时修筑堵塞，使淮河、泗水合力足以对抗黄河，那么淮水的故道可以恢复，高邮、宝应的大患可以减轻。如果兴化、盐城海口淤塞，也应该大力疏浚。并在湖堤上多建减水大闸，堤下多开支河。总之，没有不先治理黄河而可以治理淮河的，也没有不疏通淮水而可以巩固堤坝的。”此事交给河漕诸臣商议。
淮水从清口流出，是因为黄河水从老黄河奔流注入，而老黄河长期淤塞，不久又堵塞，淮水仍然涨溢。给事中刘铉请求紧急开通海口，并选派大臣会同河漕诸臣前往治理。于是任命吴桂芳为工部尚书兼管河漕，并裁撤总河都御史的官职。吴桂芳刚接受任命就去世了。
万历六年夏天，潘季驯接替。当时给事中李涞请求多疏浚海口，以引导众水归海。给事中王道成则请求堵塞崔镇决口，修筑桃源、宿迁的长堤，修理高家堰，开挖恢复老黄河。一并交给河臣商议。潘季驯与督漕侍郎江一麟观察水势，上奏说：
「海口自云梯关四套以下，阔七八里至十余里，深三四丈。欲别议开凿，必须深阔相类，方可注放，工力甚难。且未至海口，干地犹可施工，其将入海之地，潮汐往来，与旧口等耳。旧口皆系积沙，人力虽不可浚，水力自能冲刷，海无可浚之理。惟当导河归海，则以水治水，即浚海之策也。河亦非可以人力导，惟当缮治堤防，俾无旁决，则水由地中，沙随水去，即导河之策也。
“海口从云梯关四套以下，宽七八里到十余里，深三四丈。想要另议开凿，必须深度宽度相类似，才能注水排放，工程难度很大。而且未到海口的地方，干地还可以施工，那些将要入海的地方，潮汐往来，与旧口相同。旧口都是积沙，人力虽然不能疏浚，水力自然能够冲刷，海口没有可以疏浚的道理。只应当引导黄河归入大海，那么以水治水，就是疏浚海口的策略。黄河也不是可以用人力引导的，只应当修缮堤防，使它不向旁处决口，那么水在河道中流淌，沙随水去，这就是引导黄河的策略。
频年以来，日以缮堤为事，顾卑薄而不能支，迫近而不能容，杂以浮沙而不能久。是以河决崔镇，水多北溃，为无堤也。淮决高家堰、黄浦口，水多东溃，堤弗固也。不咎制之未备，而咎筑堤为下策，岂通论哉！上流既旁溃，又岐下流而分之，其趋云梯入海口者，譬犹强弩之末耳。水势益分则力益弱，安能导积沙以注海？
“连年以来，天天以修缮堤防为事，但堤坝低矮单薄而不能支撑，过于迫近河道而不能容纳，掺杂浮沙而不能持久。因此黄河在崔镇决口，水多向北溃决，是因为没有堤坝。淮河在高家堰、黄浦口决口，水多向东溃决，是因为堤坝不坚固。不责备治理措施不完备，却责备筑堤是下策，难道是通达的议论吗？上游既然向旁处溃决，又在下游分叉分流，那些流向云梯关入海的水流，好比强弩之末。水势越分则力量越弱，怎么能引导积沙注入大海呢？
故今日浚海急务，必先塞决以导河，尤当固堤以杜决，而欲堤之不决，必真土而勿杂浮沙，高厚而勿惜巨费，让远而勿与争地，则堤乃可固也。沿河堤固，而崔镇口塞，则黄不旁决而冲漕力专。高家堰筑，朱家口塞，则淮不旁决而会黄力专。淮、黄既合，自有控海之势。又惧其分而力弱也，必暂塞清江浦河，而严司启闭以防其内奔。姑置草湾河，而专复云梯以还其故道。仍接筑淮安新城长堤，以防其末流。使黄、淮力全，涓滴悉趋于海，则力强且专，下流之积沙自去，海不浚而辟，河不挑而深，所谓固堤即以导河，导河即以浚海也。」
“所以今天疏浚海口的紧急任务，必须先堵塞决口以引导黄河，尤其应当巩固堤坝以杜绝决口，而想要堤坝不决口，必须用真土而不要掺杂浮沙，加高加厚而不要吝惜巨大费用，让出远距离而不要与河争地，那么堤坝才能坚固。沿河堤坝坚固，而崔镇口堵塞，那么黄河不向旁处决口而冲刷漕渠的力量专一。高家堰修筑，朱家口堵塞，那么淮河不向旁处决口而会合黄河的力量专一。淮河、黄河合流后，自然有控制海口的形势。又担心它们分流而力量减弱，必须暂时堵塞清江浦河，并严格管理启闭以防止其向内奔流。暂且搁置草湾河，而专门恢复云梯关以回到故道。仍然接续修筑淮安新城的长堤，以防止其末流。使黄河、淮河的力量完整，每一滴水都趋向大海，那么力量强大且专一，下游的积沙自然去除，海口不疏浚而自开，河道不挑挖而自深，这就是所谓的巩固堤坝就是引导黄河，引导黄河就是疏浚海口。”
又言：「黄水入徐，历邳、宿、桃、清，至清口会淮而东入海。淮水自洛及凤，历盱、泗，至清口会河而东入海。此两河故道也。元漕江南粟，则由扬州直北庙湾入海，未尝溯淮。陈瑄始堤管家诸湖，通淮为运道。虑淮水涨溢，则筑高家堰堤以捍之，起武家墩，经大、小涧至阜宁湖，而淮不东侵。又虑黄河涨溢，则堤新城北以捍之，起清江浦，沿钵池山、柳浦湾迤东，而黄不南侵。
又说：“黄河水进入徐州，经过邳州、宿迁、桃源、清河，到清口会合淮河向东入海。淮河水从洛阳和凤阳，经过盱眙、泗州，到清口会合黄河向东入海。这是两条河的故道。元朝漕运江南的粮食，是从扬州直接向北到庙湾入海，不曾逆流而上到淮河。陈瑄才开始在管家等湖筑堤，连通淮河作为运道。担心淮水涨溢，就修筑高家堰堤来防御，从武家墩开始，经过大涧、小涧到阜宁湖，这样淮水就不向东侵袭。又担心黄河涨溢，就在新城北面筑堤来防御，从清江浦开始，沿着钵池山、柳浦湾向东延伸，这样黄河就不向南侵袭。
其后，堤岸渐倾，水从高堰决入，淮郡遂同鱼鳖。而当事者未考其故，谓海口壅闭，宜亟穿支渠。讵知草湾一开，西桥以上正河遂至淤阻。夫新河阔二十余丈，深仅丈许，较故道仅三十之一，岂能受全河之水？下流既壅，上流自溃，此崔镇诸口所由决也。今新河复塞，故河渐已通流，虽深阔未及原河十一，而两河全下，沙随水刷，欲其全复河身不难也。河身既复，阔者七八里，狭亦不下三四百丈，滔滔东下，何水不容？匪惟不必别凿他所，即草湾亦可置勿浚矣。
“此后，堤岸逐渐倾斜，水从高家堰决口涌入，淮安郡城于是如同鱼鳖。而当事者不考察其原因，说海口堵塞，应该赶紧开挖支渠。怎知草湾一开，西桥以上的正河就淤塞受阻。那新河宽二十多丈，深仅一丈左右，比起故道只有三十分之一，怎么能承受整条黄河的水？下游既然堵塞，上游自然溃决，这就是崔镇等口决口的原因。如今新河又堵塞，故河逐渐通流，虽然深度宽度不及原河的十分之一，但两条河的水全部下泄，沙随水刷，想要完全恢复河床并不难。河床恢复后，宽的地方七八里，窄的地方也不下三四百丈，滔滔东下，什么水不能容纳？不仅不必另外开凿其他地方，就是草湾也可以搁置不用疏浚了。”
故为今计，惟修复陈瑄故迹，高筑南北两堤，以断两河之内灌，则淮、扬昏垫可免。塞黄浦口，筑宝应堤，浚东关等浅，修五闸，复五坝，则淮南运道无虞。坚塞桃源以下崔镇口诸决，则全河可归故道。黄、淮既无旁决，并驱入海，则沙随水刷，海口自复，而桃、清浅阻，又不足言。此以水治水之法也。若夫爬捞之说，仅可行诸闸河，前入屡试无功，徒费工料。」
所以从现在的策略来看，只有修复陈瑄原来的工程，加高南北两道堤坝，来阻断两条河向内倒灌，那么淮安、扬州的洪涝灾害就可以避免。堵塞黄浦口，修筑宝应堤，疏浚东关等浅滩，修复五座水闸，恢复五座水坝，那么淮南的运输水道就没有忧虑了。坚决堵塞桃源以下崔镇口等各处决口，那么整条黄河就可以回归原来的河道。黄河、淮河既然没有旁流决口，一起奔流入海，那么泥沙就会随着水流冲刷，海口自然恢复，而桃源、清河的浅滩堵塞问题，也就不足挂齿了。这是用水治水的方法。至于那种用工具捞沙的说法，只能在闸河中使用，前人多次尝试都没有效果，白白浪费工料。
于是条上六议：曰塞决口以挽正河，曰筑堤防以杜溃决，曰复闸坝以防外河，曰创滚水坝以固堤岸，曰止浚海工程以省糜费，曰寝开老黄河之议以仍利涉。帝悉从其请。
于是潘季驯分条上奏六项建议：一是堵塞决口以挽回正河，二是修筑堤防以杜绝溃决，三是恢复闸坝以防备外河，四是创建滚水坝以加固堤岸，五是停止疏浚海口的工程以节省浪费，六是搁置开挖老黄河的提议以保持通航便利。皇帝全部同意了他的请求。
七年十月，两河工成，赉季驯、一麟银币，而遣给事中尹瑾勘实。八年春进季驯太子太保工部尚书，荫一子。一麟等迁擢有差。是役也，筑高家堰堤六十余里，归仁集堤四十余里，柳浦湾堤东西七十余里，塞崔镇等决口百三十，筑徐、睢、邳、宿、桃、清两岸遥堤五万六千余丈，砀、丰大坝各一道，徐、沛、丰、砀缕堤百四十余里，建崔镇、徐升、季泰、三义减水石坝四座，迁通济闸于甘罗城南，淮、扬间堤坝无不修筑，费帑金五十六万有奇。其秋擢季驯南京兵部尚书。季驯又请复新集至小浮桥故道，给事中王道成、河南巡抚周鉴等不可而止。自桂芳、季驯时罢总河不设，其后但以督漕兼理河道。高堰初筑，清口方畅，流连数年，河道无大患。
万历七年十月，黄河、淮河工程完工，赏赐潘季驯、江一麟银币，并派给事中尹瑾核查实际情况。八年春天，晋升潘季驯为太子太保、工部尚书，荫庇一个儿子。江一麟等人也各有升迁。这次工程，修筑高家堰堤六十多里，归仁集堤四十多里，柳浦湾堤东西七十多里，堵塞崔镇等决口一百三十处，修筑徐州、睢宁、邳州、宿迁、桃源、清河两岸遥堤五万六千多丈，砀山、丰县大坝各一道，徐州、沛县、丰县、砀山缕堤一百四十多里，建造崔镇、徐升、季泰、三义减水石坝四座，将通济闸迁到甘罗城南，淮安、扬州之间的堤坝没有不修筑的，花费国库银两五十六万多。这年秋天，提升潘季驯为南京兵部尚书。潘季驯又请求恢复新集到小浮桥的故道，给事中王道成、河南巡抚周鉴等人不同意而作罢。从潘季驯、吴桂芳时起，不再设总河一职，此后只由督漕官员兼管河道。高家堰刚筑成时，清口畅通，连续几年，河道没有大的祸患。
至十五年，封丘、偃师、东明、长垣屡被冲决。大学士申时行言：「河所决地在三省，守臣画地分修，易推委。河道未大坏，不必设都御史，宜遣风力老成给事中一人行河。」乃命工科都给事中常居敬往。居敬请修筑大社集东至白茅集长堤百里。从之。
到万历十五年，封丘、偃师、东明、长垣多次被冲决。大学士申时行说：“黄河决口的地方涉及三个省，地方官员各自划分区域分别修理，容易互相推诿。河道还没有大坏，不必设置都御史，应该派遣一位有魄力、老成的给事中巡视河道。”于是命令工科都给事中常居敬前往。常居敬请求修筑从大社集东到白茅集的长堤一百里。皇帝同意了。
初，黄河由徐州小浮桥入运，其河深且近洪，能刷洪以深河，利于运道。后渐徙沛县飞云桥及徐州大、小溜沟。至嘉靖末，决邵家口，出秦沟，由浊河口入运，河浅，迫茶城，茶城岁淤，运道数害。万历五年冬，河复南趋，出小浮桥故道，未几复堙。潘季驯之塞崔镇也，厚筑堤岸，束水归漕。嗣后水发，河臣辄加堤，而河身日高矣。于是督漕佥都御史杨一魁欲复黄河故道，请自归德以下丁家道口浚至石将军庙，令河仍自小浮桥出。又言：「善治水者，以疏不以障。年来堤上加堤，水高凌空，不啻过颡。滨河城郭，决水可灌。宜测河身深浅，随处挑浚，而于黄河分流故道，设减水石门以泄暴涨。」给事中王士性则请复老黄河故道。大略言：
起初，黄河从徐州小浮桥进入运河，这段河道水深且靠近洪泽湖，能够冲刷洪泽湖以加深河道，对运输水道有利。后来逐渐改道到沛县飞云桥和徐州的大、小溜沟。到嘉靖末年，在邵家口决口，从秦沟流出，由浊河口进入运河，河道变浅，逼近茶城，茶城每年淤积，运输水道多次受害。万历五年冬天，黄河又向南流，从小浮桥故道流出，不久又淤塞了。潘季驯堵塞崔镇时，加厚加固堤岸，约束河水归入漕渠。此后河水上涨，河道官员就加高堤坝，而河床却日益抬高。于是督漕佥都御史杨一魁想恢复黄河故道，请求从归德以下的丁家道口疏浚到石将军庙，让黄河仍然从小浮桥流出。又说：“善于治水的人，用疏导而不是用堵塞。近年来堤上加堤，水位高悬空中，简直超过额头。沿河的城市，决口的水可以灌进去。应该测量河床的深浅，随处挑挖疏浚，并在黄河分流的故道上，设置减水石门来排泄暴涨的洪水。”给事中王士性则请求恢复老黄河故道。大致说：
「自徐而下，河身日高，而为堤以束之，堤与徐州城等。束益急，流益迅，委全力于淮而淮不任。故昔之黄、淮合，今黄强而淮益缩，不复合矣。黄强而一启天妃、通济诸闸，则灌运河如建瓴。高、宝一梗，江南之运坐废。淮缩则退而侵泗。为祖陵计，不得不建石堤护之。堤增河益高，根本大可虞也。河至清河凡四折而后入海。淮安、高、宝、盐、兴数百万生灵之命托之一丸泥，决则尽成鱼暇矣。
“从徐州往下，河床日益抬高，而用堤坝来约束它，堤坝与徐州城一样高。约束得越紧，水流就越急，把全部力量施加给淮河，而淮河承受不住。所以过去黄河、淮河合流，现在黄河强而淮河更加萎缩，不再合流了。黄河强，一旦开启天妃、通济等闸门，就会像从屋顶往下倒水一样灌入运河。高邮、宝应一旦堵塞，江南的运输就荒废了。淮河萎缩就后退而侵入泗州。为了祖陵考虑，不得不修建石堤来保护它。堤坝增高，河床也更高，根本大事很令人担忧。黄河到清河共经过四次转弯才入海。淮安、高邮、宝应、盐城、兴化数百万生灵的性命寄托在一小块泥土上，一旦决口就都变成鱼虾了。
纷纷之议，有欲增堤泗州者，有欲开颜家、灌口、永济三河，南甃高家堰、北筑滚水坝者。总不如复河故道，为一劳永逸之计也。河故道由三义镇达叶家冲与淮合，在清河县北别有济运河，在县南盖支河耳。河强夺支河，直趋县南，而自弃北流之道，然河形固在也。自桃源至瓦子滩凡九十里，ＡＨ下不耕，无室庐填墓之碍，虽开河费巨，而故道一复，为利无穷。」
纷纷扬扬的议论，有想加高泗州堤坝的，有想开挖颜家、灌口、永济三条河的，南面砌高家堰、北面筑滚水坝的。都不如恢复黄河故道，作为一劳永逸的计策。黄河故道从三义镇到达叶家冲与淮河汇合，在清河县北面另外有一条济运河，在县南面大概是一条支河。黄河强夺支河，直冲县南，而自己放弃了北流的河道，但河道的形状还在。从桃源到瓦子滩共九十里，地势低洼没有耕种，没有房屋坟墓的妨碍，虽然开挖河道费用巨大，但故道一旦恢复，利益无穷。”
时帝从居敬言，罢老黄河议，而季驯抵官，言：「亲集故道，故老言『铜帮铁底』，当开，但岁俭费繁，未能遽行。」又言：「黄水浊而强，汶、泗清且弱，交会茶城。伏秋黄水发，则倒灌人漕，沙停而淤，势所必至。然黄水一落，漕即从之，沙随水去，不浚自通，纵有浅阻，不过旬日。往时建古洪、内华二闸，黄涨则闭闸以遏浊流，黄退则启闸以纵泉水。近者居敬复增建镇口闸，去河愈近，则吐纳愈易。但当严闸禁如清江浦三闸之法，则河渠永赖矣。」帝方委季驯，即从其言，罢故道之议。未几，水患益甚。
当时皇帝听从常居敬的话，放弃了开挖老黄河的提议，而潘季驯到任后，说：“我亲自到故道查看，老人们说‘铜帮铁底’，应该开挖，但年景不好、费用繁多，不能马上进行。”又说：“黄河水浑浊而强劲，汶水、泗水清澈而柔弱，在茶城交汇。伏天秋天黄河水发，就会倒灌入漕渠，泥沙停留而淤积，这是必然的趋势。但黄河水一落，漕渠水就跟着下落，泥沙随水而去，不用疏浚自然通畅，即使有浅滩堵塞，也不过十天。过去修建古洪、内华两座闸门，黄河涨水就关闭闸门以阻挡浊流，黄河退水就开启闸门以放出清水。近来常居敬又增建了镇口闸，离河越近，吞吐就越容易。只要严格闸门禁令，像清江浦三闸那样，那么河渠就永远有依靠了。”皇帝正信任潘季驯，就听从了他的话，放弃了开挖故道的提议。不久，水患更加严重。
十七年六月，黄水暴涨，决兽医口月堤，漫李景高口新堤，冲入夏镇内河，坏田庐，没人民无算。十月，决口塞。十八年，大溢，徐州水积城中者逾年。众议迁城改河。季驯浚魁山支河以通之，起苏伯湖至小河口，积水乃消。十九年九月，泗州大水，州治淹三尺，居民沉溺十九，浸及祖陵。而山阳复河决，江都、邵伯又因湖水下注，田庐浸伤。工部尚书曾同亨上其事，议者纷起。乃命工科给事中张贞观往泗州勘视水势，而从给事中杨其休言，放季驯归，用舒应龙为工部尚书总督河道。
万历十七年六月，黄河水暴涨，冲决了兽医口的月堤，漫过李景高口的新堤，冲入夏镇内河，毁坏农田房屋，淹死人民无数。十月，决口被堵塞。十八年，河水大泛滥，徐州城中的积水超过一年。众人议论迁城改河。潘季驯疏浚魁山支河来疏导积水，从苏伯湖到小河口，积水才消退。十九年九月，泗州发大水，州治被淹三尺，居民十分之九被淹死，积水浸及祖陵。而山阳又发生河决，江都、邵伯又因湖水下注，农田房屋被淹受损。工部尚书曾同亨上报此事，议论纷纷。于是命令工科给事中张贞观前往泗州勘察水势，并听从给事中杨其休的建议，让潘季驯退休回家，任用舒应龙为工部尚书，总督河道。
二十年三月，季驯将去，条上辨惑者六事，力言河不两行，新河不当开，支渠不当浚。又著书曰河防一览，大旨在筑堤障河，束水归漕；筑堰障淮，逼淮注黄。以清刷浊，沙随水去。合则流急，急则荡涤而河深；分则流缓，缓则停滞而沙积。上流既急，则海口自辟而无待于开。其治堤之法，有缕堤以束其流，有遥堤以宽其势，有滚水坝以泄其怒。法甚详，言甚辩。然当是时，水势横溃，徐、泗、淮、扬间无岁不受患，祖陵被水。季驯谓当自消，已而不验。于是季驯言诎，而分黄导淮之议由此起矣。
万历二十年三月，潘季驯即将离任，分条上奏辨明疑惑的六件事，极力主张黄河不能有两条河道，新河不应当开挖，支渠不应当疏浚。又著书《河防一览》，主要宗旨是筑堤阻挡黄河，约束河水归入漕渠；筑堰阻挡淮河，逼迫淮河注入黄河。用清水冲刷浊水，泥沙随水而去。合流则水流湍急，湍急则荡涤而河床加深；分流则水流缓慢，缓慢则停滞而泥沙淤积。上游水流湍急，那么海口自然开辟而无需人工开挖。他治理堤坝的方法，有缕堤来约束水流，有遥堤来放宽水势，有滚水坝来排泄洪水的凶猛。方法很详细，论述很雄辩。但当时水势横流泛滥，徐州、泗州、淮安、扬州之间没有一年不受灾，祖陵被水淹。潘季驯说水会自行消退，后来没有应验。于是潘季驯的言论被驳倒，而分黄河、导淮河的议论从此兴起了。
贞观抵泗州言：「臣谒祖陵，见泗城如水上浮盂，盂中之水复满。祖陵自神路至三桥、丹墀，无一不被水。且高堰危如累卵，又高、宝隐祸也。今欲泄淮，当以辟海口积沙为第一义。然泄淮不若杀黄，而杀黄于淮流之既合，不若杀于未合。但杀于既合者与运无妨，杀于未合者与运稍碍。别标本，究利害，必当杀于未合之先。至于广入海之途，则自鲍家口、黄家营至鱼沟、金城左右，地势颇下，似当因而利导之。」贞观又会应龙及总漕陈于陛等言：「淮、黄同趋者惟海，而淮之由黄达海者惟清口。自海沙开浚无期，因而河身日高；自河流倒灌无已，因而清口日塞。以致淮水上浸祖陵，漫及高、宝，而兴、泰运堤亦冲决矣。今议辟清口沙，且分黄河之流于清口上流十里地，去口不远，不至为运道梗。分于上，复合于下，则冲海之力专。合必于草湾之下，恐其复冲正河，为淮城患也。塞鲍家口、黄家营二决，恐横冲新河，散溢无归。两岸俱堤，则东北清沭、海安洼下地不虞溃决。计费凡三十六万有奇。若海口之塞，则潮汐莫窥其涯，难施畚锸。惟淮、黄合流东下，河身涤而渐深，海口刷而渐辟，亦事理之可必者。」帝悉从其请。乃议于清口上流北岸，开腰铺支河达于草湾。
张贞观到达泗州后说：“臣拜谒祖陵，看到泗州城像水上的浮盂，盂中的水又满了。祖陵从神路到三桥、丹墀，没有一处不被水淹。而且高家堰危险得像堆叠的鸡蛋，又是高邮、宝应的隐患。现在要排泄淮河，应当以开辟海口积沙为第一要务。但排泄淮河不如削弱黄河，而在淮河水流已经汇合后削弱黄河，不如在未汇合时削弱。但在汇合后削弱对运输没有妨碍，在未汇合时削弱对运输稍有妨碍。要区分标本，探究利害，必须在未汇合之前削弱。至于扩大入海的通道，从鲍家口、黄家营到鱼沟、金城左右，地势较低，似乎应当顺势利导。”张贞观又会同舒应龙和总漕陈于陛等人说：“淮河、黄河共同流向的只有大海，而淮河通过黄河到达大海的只有清口。自从海沙开浚无期，因而河床日益抬高；自从河流倒灌不止，因而清口日益堵塞。以致淮河水上浸祖陵，漫延到高邮、宝应，而兴化、泰州的运堤也被冲决了。现在商议开辟清口的积沙，并且在清口上游十里处分流黄河，离清口不远，不至于成为运输水道的障碍。在上游分流，在下游再汇合，那么冲击大海的力量就集中。汇合必须在草湾以下，恐怕它再次冲击正河，成为淮安城的祸患。堵塞鲍家口、黄家营两处决口，恐怕它横向冲击新河，散溢没有归宿。两岸都筑堤，那么东北的清河、沭阳、海安等低洼地区就不担心溃决了。估计费用共三十六万多。至于海口的堵塞，潮汐看不到边际，难以使用工具。只有淮河、黄河合流东下，河床被冲刷而逐渐加深，海口被冲刷而逐渐开辟，这也是事理上可以肯定的。”皇帝全部听从了他们的请求。于是商议在清口上游北岸，开挖腰铺支河到达草湾。
不久淮水自己冲决了张福堤。直隶巡按彭应参说：“祖陵估计可以没有危险，而且正在东方防备倭寇警报，应该暂停河工。”部议命令河臣仔细考虑。舒应龙、张贞观说：“为祖陵长远考虑，支河实在是必不可少的工程，请求等到明年春天倭寇警报平息后再进行。”这件事于是搁置了。
二十一年春，贞观报命，议开归、徐达小河口，以救徐、邳之溢；导浊河入小浮桥故道，以纾镇口之患。下总河会官集议，未定。五月，大雨，河决单县黄堌口，一由徐州出小浮桥，一由旧河达镇口闸。邳城陷水中，高、宝诸湖堤决口无算。明年，湖堤尽筑塞，而黄水大涨，清口沙垫，淮水不能东下，于是挟上源阜陵诸湖与山溪之水，暴浸祖陵，泗城淹没。二十三年，又决高邮中堤及高家堰、高良涧，而水患益急矣。
万历二十一年春天，张贞观复命，建议开挖归德、徐州到达小河口，以解救徐州、邳州的泛滥；引导浊河进入小浮桥故道，以缓解镇口的祸患。下发到总河会同官员集中商议，没有定论。五月，下大雨，黄河在单县黄堌口决口，一股从徐州出小浮桥，一股从旧河到达镇口闸。邳州城陷入水中，高邮、宝应等湖的堤坝决口无数。第二年，湖堤全部修筑堵塞，但黄河水大涨，清口泥沙淤垫，淮水不能东下，于是挟带上源阜陵等湖和山溪的水，突然浸淹祖陵，泗州城被淹没。万历二十三年，又冲决了高邮中堤和高家堰、高良涧，水患更加紧急了。
先是，御史陈邦科言：「固堤束水未收刷沙之利，而反致冲决。法当用浚，其方有三。冬春水涸，令沿河浅夫乘时捞浅，则沙不停而去，一也。官民船往来，船尾悉系钯犁，乘风搜涤，则沙不宁而去，二也。仿水磨、水碓之法，置为木机，乘水滚荡，则沙不留而去，三也。至淮必不可不会黄，故高堰断不可弃。湖溢必伤堤，故周家桥溃处断不可开。已弃之道必淤满，故老黄河、草湾等处断不可。」疏下所司议。户部郎中华存礼则请复黄河故道，并浚草湾。而是时腰铺犹未开，工部侍郎沈节甫言：「复黄河未可轻议，至诸策皆第补偏救弊而已，宜概停罢。」乃召应龙还工部，时二十二年九月也。
在此之前，御史陈邦科说：“加固堤坝约束水流，没有收到冲刷泥沙的好处，反而导致冲决。方法应当用疏浚，其办法有三种。冬春水枯时，让沿河的浅夫趁机捞浅，那么泥沙不停留而被除去，这是第一。官民船只往来，船尾都系上耙犁，乘风搜刮荡涤，那么泥沙不得安宁而被除去，这是第二。仿效水磨、水碓的方法，设置木制机械，乘水滚动荡涤，那么泥沙不残留而被除去，这是第三。至于淮河一定不能不与黄河汇合，所以高家堰绝对不能放弃。湖水泛滥一定会伤害堤坝，所以周家桥的溃口绝对不能开。已经废弃的河道一定会淤满，所以老黄河、草湾等处绝对不能开。”奏疏下发到有关部门商议。户部郎中华存礼则请求恢复黄河故道，并疏浚草湾。而这时腰铺还没有开挖，工部侍郎沈节甫说：“恢复黄河不能轻易议论，至于各种策略都只是补偏救弊罢了，应该全部停罢。”于是召舒应龙回工部，当时是万历二十二年九月。
既而给事中吴应明言：「先因黄河迁徙无常，设遥、缕二堤束水归漕，及水过沙停，河身日高，徐、邳以下居民尽在水底。今清口外则黄流阻遏，清口内则淤沙横截，强河横灌上流约百里许，淮水仅出沙上之浮流，而潴蓄于盱、泗者遂为祖陵患矣。张贞观所议腰铺支河归之草湾，或从清河南岸别开小河至骆家营、马厂等地，出会大河，建闸启闭，一遇运浅，即行此河，亦策之便者。」至治泗水，则有议开老子山，引淮水入江者。宜置闸以时启闭，拆张福堤而堤清口，使河水无南向。部议下河漕诸臣会勘。直隶巡按牛应元因谒祖陵，目击河患，绘图以进，因上疏言：
不久，给事中吴应明说：“先前因为黄河迁徙无常，设置了遥堤和缕堤来约束河水归入河道，但水过后泥沙停留，河床日益增高，徐州、邳州以下的居民全在水底。如今清口外有黄流阻遏，清口内有淤沙横截，强河横灌上游约百里左右，淮水只能从沙上浮流而出，而蓄积在盱眙、泗州的淮水就成了祖陵的祸患。张贞观所提议的腰铺支河归入草湾，或者从清河南岸另开一条小河到骆家营、马厂等地，流出汇入大河，建闸门启闭，一旦遇到运河水浅，就通行这条河，也是便利的策略。”至于治理泗水，有人提议开凿老子山，引淮水入江。应该设置闸门按时启闭，拆除张福堤而在清口筑堤，使河水不向南流。部议下达给河漕诸臣会勘。直隶巡按牛应元因拜谒祖陵，亲眼看到河患，绘制地图进呈，并上疏说：
「黄高淮壅，起于嘉靖末年河臣凿徐、吕二洪巨石，而沙日停，河身日高，溃决由此起。当事者计无复之，两岸筑长堤以束，曰缕堤。缕堤复决，更于数里外筑重堤以防，曰遥堤。虽岁决岁补，而莫可谁何矣。
“黄河水位高、淮水壅塞，起源于嘉靖末年河臣凿开徐州、吕梁二洪的巨石，导致泥沙日益停留，河床日益增高，溃决由此发生。当政者无计可施，在两岸筑长堤来约束河水，称为缕堤。缕堤再次决口，又在数里外筑重堤来防范，称为遥堤。虽然年年决口年年修补，但已无可奈何。
黄、淮交会，本自清河北二十里骆家营，折而东至大河口会淮，所称老黄河是也。陈瑄以其迂曲，从骆家营开一支河，为见今河道，而老黄河淤矣。万历间，复开草湾支河，黄舍故道而趋，以致清口交会之地，二水相持，淮不胜黄，则窜入各闸口，淮安士民于各闸口筑一土埂以防之。嗣后黄、淮暴涨，水退沙停，清口遂淤，今称门限沙是也。当事者不思挑门限沙，乃傍土埂筑高堰，横亘六十里，置全淮正流之口不事，复将从旁入黄之张福口一并筑堤塞之，遂倒流而为泗陵患矣。前岁，科臣贞观议辟门限沙，裁张福堤，其所重又在支河腰铺之开。
黄河与淮水交汇处，原本在清河北二十里的骆家营，折向东到大河口汇入淮水，这就是所说的老黄河。陈瑄因为它迂回曲折，从骆家营开了一条支河，成为现在的河道，而老黄河就淤塞了。万历年间，又开了草湾支河，黄河舍弃故道而流向那里，以致清口交汇处，两水相持不下，淮水敌不过黄河，就窜入各闸口，淮安的士民在各闸口筑了一道土埂来防范。此后黄河、淮水暴涨，水退沙停，清口于是淤塞，就是现在所称的门限沙。当政者不想着挑开门限沙，反而在土埂旁筑起高堰，横亘六十里，置全淮正流之口于不顾，又将从旁入黄的张福口一并筑堤堵塞，于是淮水倒流成为泗州祖陵的祸患。前年，科臣张贞观提议开辟门限沙，裁撤张福堤，其重点又在于开凿腰铺支河。
总之，全口淤沙未尽挑辟，即腰铺工成，淮水未能出也，况下流鲍、王诸口已决，难以施工。岂若复黄河故道，尽辟清口淤沙之为要乎？且疏上流，不若科臣应明所议，就草湾下流浚诸决口，俾由安东归五港，或于周家桥量为疏通，而急塞黄堌口，挑萧、砀管道，浚符离浅阻。至宿迁小河为淮水入黄正路，急宜挑辟，使有所归。」
总之，全口的淤沙没有完全挑开，即使腰铺工程完成，淮水也无法流出，何况下流鲍、王等口已经决口，难以施工。哪里比得上恢复黄河故道，完全开辟清口淤沙来得重要呢？而且疏通上流，不如科臣吴应明所提议的，在草湾下流疏浚各决口，让水从安东归入五港，或者在周家桥适当疏通，并紧急堵塞黄堌口，挑开萧县、砀山的管道，疏浚符离的浅阻。至于宿迁小河是淮水入黄的正路，应紧急挑开，使水有归宿。”
应龙言：「张福堤已决百余丈，清口方挑沙，而腰铺之开尤不可废。」工部侍郎沈思孝因言：「老黄河自三义镇至叶家冲仅八千余丈，河形尚存。宜亟开浚，则河分为二，一从故道抵颜家河入海，一从清口会淮，患当自弭。请遣风力科臣一人，与河漕诸臣定画一之计。」乃命礼科给事中张企程往勘。而以水患累年，迄无成画，迁延糜费，罢应龙职为民，常居敬、张贞观、彭应参等皆谴责有差。御史高举请「疏周家桥，裁张福堤，辟门限沙，建滚水石坝于周家桥、大小涧口、武家墩、绿杨沟上下，而坝外浚河筑岸，使行地中。改塘埂十二闸为坝，灌闸外十二河，以辟入海之路。浚芒稻河，且多建滨江水闸，以广入江之途。然海口日壅，则河沙日积，河身日高，而淮亦不能安流。有灌口者，视诸口颇大，而近日所决蒋家、鲍家、畀家三口直与相射，宜挑浚成河，俾由此入海。」工部主事樊兆程亦议辟海口，而言：「旧海口决不可浚，当自鲍家营至五港口挑浚成河，令从灌口入海。」俱下工部。请并委企程勘议。
应龙说：“张福堤已经决口百余丈，清口正在挑沙，而腰铺的开凿尤其不可废弃。”工部侍郎沈思孝因此说：“老黄河从三义镇到叶家冲只有八千余丈，河道形状还在。应紧急开浚，这样河水分成两条，一条从故道到颜家河入海，一条从清口汇合淮水，祸患应当自行消除。请派遣一位有魄力的科臣，与河漕诸臣制定统一计划。”于是命礼科给事中张企程前往勘察。但因水患多年，始终没有定策，拖延浪费，罢免应龙官职为民，常居敬、张贞观、彭应参等人都受到不同程度的谴责。御史高举请求“疏通周家桥，裁撤张福堤，开辟门限沙，在周家桥、大小涧口、武家墩、绿杨沟上下建造滚水石坝，并在坝外疏浚河道、修筑堤岸，使水行于地下。将塘埂十二闸改为坝，灌溉闸外十二条河，以开辟入海之路。疏浚芒稻河，并多建滨江水闸，以拓宽入江的途径。然而海口日益壅塞，则河沙日益堆积，河床日益增高，而淮水也不能安稳流淌。有一个灌口，比其他各口都大，而近日所决的蒋家、鲍家、畀家三口正好与它相对，应挑浚成河，使水由此入海。”工部主事樊兆程也提议开辟海口，并说：“旧海口决不可浚，应当从鲍家营到五港口挑浚成河，使水从灌口入海。”这些建议都下到工部。请求一并委托张企程勘察商议。
是时，总河工部尚书杨一魁被论，乞罢，因言：「清口宜浚，黄河故道宜复，高堰不必修，石堤不必砌，减水闸坝不必用。」帝不允辞，而诏以尽心任事。御史夏之臣则言：「海口沙不可劈，草湾河不必浚，腰铺新河四十里不必开，云梯关不必辟，惟当急开高堰，以救祖陵。」且言：「历年以来，高良涧土堤每遇伏秋即冲决，大涧口石堤每遇汹涌即崩溃。是高堰在，为高、宝之利小；而高堰决，则为高、宝之害大也。孰若明议而明开之，使知趋避乎？」给事中黄运泰则又言：「黄河下流未泄，而遽开高堰、周桥以泄淮水，则淮流南下，黄必乘之，高、宝间尽为沼，而运道月河必冲决矣。不如浚五港口，达灌口门，以入于海之为得也。」诏并行勘议。
这时，总河工部尚书杨一魁被弹劾，请求罢免，并说：“清口应当疏浚，黄河故道应当恢复，高堰不必修，石堤不必砌，减水闸坝不必用。”皇帝不允许他辞职，而下诏让他尽心任职。御史夏之臣则说：“海口沙不可劈开，草湾河不必疏浚，腰铺新河四十里不必开凿，云梯关不必开辟，只应当紧急开凿高堰，以拯救祖陵。”并且说：“历年以来，高良涧的土堤每到伏秋季节就被冲决，大涧口的石堤每到汹涌时即崩溃。这样看来，高堰存在，对高邮、宝应的利益小；而高堰决口，对高邮、宝应的危害大。哪里比得上公开商议并公开开凿，让人们知道趋避呢？”给事中黄运泰则又说：“黄河下流没有宣泄，就急忙开高堰、周桥来泄淮水，那么淮水南流，黄河必定乘机而入，高邮、宝应之间全成沼泽，而运道月河必定被冲决。不如疏浚五港口，通达灌口门，以入海更为妥当。”皇帝下诏一并勘察商议。
企程乃上言：「前此河不为陵患，自隆庆末年高、宝、淮、扬告急，当事狃于目前，清口既淤，又筑高堰以遏之，堤张福以束之，障全淮之水与黄角胜，不虞其势不敌也。迨后甃石加筑，堙塞愈坚，举七十二溪之水汇于泗者，仅留数丈一口出之，出者什一，停者什九。河身日高，流日壅，淮日益不得出，而潴蓄日益深，安得不倒流旁溢为泗陵患乎？今议疏淮以安陵，疏黄以导淮者，言人人殊。而谓高堰当决者，臣以为屏翰淮、扬，殆不可少。莫若于其南五十里开周家桥注草子湖，大加开浚，一由金家湾入芒稻河注之江，一由子婴沟入广洋湖达之海，则淮水上流半有宣泄矣。于其北十五里开武家墩，注永济河，由窑湾闸出口直达泾河，从射阳湖入海，则淮水下流半有归宿矣。此急救祖陵第一义也。」
张企程于是上言：“此前黄河不为祖陵之患，自隆庆末年高邮、宝应、淮安、扬州告急，当政者只顾眼前，清口既已淤塞，又筑高堰来遏阻，筑张福堤来约束，阻挡全淮之水与黄河争胜，不料其势不敌。后来用石砌筑加固，堵塞更加坚固，将七十二溪之水汇聚于泗州的，只留数丈的一个口子流出，流出的只有十分之一，停留的十分之九。河床日益增高，水流日益壅塞，淮水日益不能流出，而蓄积日益加深，怎能不倒流旁溢成为泗州祖陵的祸患呢？如今议论疏通淮水以安定祖陵，疏通黄河以引导淮水的人，说法各不相同。而认为高堰应当决开的人，臣以为它作为淮安、扬州的屏障，恐怕不可缺少。不如在其南五十里开周家桥注入草子湖，大力开浚，一条由金家湾入芒稻河注入长江，一条由子婴沟入广洋湖通达大海，这样淮水上流一半就有宣泄了。在其北十五里开武家墩，注入永济河，由窑湾闸出口直达泾河，从射阳湖入海，这样淮水下流一半就有归宿了。这是急救祖陵的第一要义。”
会是时，祖陵积水稍退，一魁以闻，帝大悦，仍谕诸臣急协议宣泄。
恰逢这时，祖陵积水稍退，杨一魁将此事上报，皇帝非常高兴，仍谕令诸臣紧急商议宣泄。
于是企程、一魁共议欲分杀黄流以纵淮，别疏海口以导黄。而督漕尚书褚𫓧则以江北岁祲，民不堪大役，欲先泄淮而徐议分黄。御史应元折衷其说，言：「导淮势便而功易，分黄功大而利远。顾河臣所请亦第六十八万金，国家亦何靳于此？」御史陈煃尝令宝应，虑周家桥既开，则以高邮、邵伯为壑，运道、民产、盐场交受其害，上疏争之，语甚激，大旨分黄为先，而淮不必深治。且欲多开入海之路，令高、宝诸湖之水皆东，而后周家桥、武家墩之水可注。而淮安知府马化龙复进分黄五难之说。颍州兵备道李弘道又谓宜开高堰。𫓧遂据以上闻。给事中林熙春驳之，言：「淮犹昔日之淮，而河非昔日之河，先是河身未高，而淮尚安流，今则河身既高，而淮受倒灌，此导淮固以为淮，分黄亦以为淮。」工部乃覆奏云：「先议开腰铺支河以分黄流，以倭儆、灾伤停寝，遂贻今日之患。今黄家坝分黄之工若复沮格，淮壅为害，谁职其咎？请令治河诸臣导淮分黄，亟行兴举。」报可。
于是张企程、杨一魁共同商议要分杀黄流以放纵淮水，另疏海口以引导黄河。而督漕尚书褚𫓧则认为江北连年灾荒，百姓不堪承受大工程，想先泄淮水再慢慢商议分黄。御史牛应元折衷其说，说：“导淮形势便利而工程容易，分黄功绩大而利益长远。只是河臣所请求的也不过六十八万金，国家又何必吝惜于此？”御史陈煃曾任职宝应，担心周家桥一旦开通，就会以高邮、邵伯为壑，运道、民产、盐场都受其害，上疏争辩，言辞很激烈，大意是分黄为先，而淮水不必深治。并且想多开入海之路，让高邮、宝应诸湖之水都向东流，然后周家桥、武家墩之水才能注入。而淮安知府马化龙又提出分黄有五难之说。颍州兵备道李弘道又认为应开高堰。褚𫓧于是据此上报。给事中林熙春驳斥他，说：“淮水还是昔日的淮水，而黄河已非昔日的黄河，先前河床不高，淮水还能安稳流淌，如今河床已高，淮水受到倒灌，这导淮固然是为了淮水，分黄也是为了淮水。”工部于是覆奏说：“先前商议开腰铺支河以分黄流，因倭警、灾伤而停止，于是留下今日之患。如今黄家坝分黄工程如果再受阻，淮水壅塞为害，谁来承担其咎？请令治河诸臣导淮分黄，迅速兴办。”皇帝批复同意。
二十四年八月，一魁兴工未竣，复条上分淮导黄事宜十事。十月，河工告成，直隶巡按御史蒋春芳以闻，复条上善后事宜十六事。乃赏赉一魁等有差。是役也，役夫二十万，开桃源黄河坝新河，起黄家嘴，至安东五港、灌口，长三百余里，分泄黄水入海，以抑黄强。辟清口沙七里，建武家墩、高良涧、周家桥石闸，泄淮水三道入海，且引其支流入江。于是泗陵水患平，而淮、扬安矣。
万历二十四年八月，杨一魁开工未完成，又分条上奏分淮导黄事宜十项。十月，河工告成，直隶巡按御史蒋春芳上报，又分条上奏善后事宜十六项。于是赏赐杨一魁等人各有差等。这次工程，役夫二十万，开凿桃源黄河坝新河，从黄家嘴起，到安东五港、灌口，长三百余里，分泄黄水入海，以抑制黄强。开辟清口沙七里，建造武家墩、高良涧、周家桥石闸，分泄淮水三道入海，并引其支流入江。于是泗州祖陵水患平息，而淮安、扬州安定。
然是时一魁专力桃、清、淮、泗间，而上流单县黄堌口之决，以为不必塞。𫓧及春芳皆请塞之。给事中李应策言：「漕臣主运，河臣主工，各自为见。宜再令析议。」一魁言：「黄堌口一支由虞城、夏邑接砀山、萧县、宿州至宿迁，出白洋河，一小支分萧县两河口，出徐州小浮桥，相距不满四十里。当疏浚与正河会，更通镇口闸里湖之水，与小浮桥二水会，则黄堌口不必塞，而运道无滞矣。」从之。于是议浚小浮桥、沂河口、小河口以济徐、邳运道，以泄砀、萧漫流，掊归仁堤以护陵寝。
然而这时杨一魁专力于桃源、清口、淮水、泗州之间，而上流单县黄堌口的决口，他认为不必堵塞。褚𫓧和蒋春芳都请求堵塞。给事中李应策说：“漕臣主管运输，河臣主管工程，各自有不同见解。应再令他们分析商议。”杨一魁说：“黄堌口一支由虞城、夏邑接砀山、萧县、宿州到宿迁，出白洋河，一小支分萧县两河口，出徐州小浮桥，相距不满四十里。应当疏浚与正河会合，再通镇口闸里湖之水，与小浮桥二水会合，那么黄堌口不必堵塞，而运道也无阻滞了。”皇帝听从。于是商议疏浚小浮桥、沂河口、小河口以接济徐州、邳州运道，以排泄砀山、萧县的漫流，拆毁归仁堤以保护陵寝。
是时，徐、邳复见清、泗运道不利，𫓧终以为忧。二十五年正月，复极言黄堌口不塞，则全河南徙，害且立见。议者亦多恐下啮归仁，为二陵患。三月，小浮桥等口工垂竣，一魁言：
这时，徐州、邳州又见清口、泗州运道不利，褚𫓧始终以此为忧。万历二十五年正月，又极力说黄堌口不堵塞，则全河南徙，祸害将立即出现。议论者也多担心下流侵蚀归仁，成为二陵之患。三月，小浮桥等口工程即将完工，杨一魁说：
「运道通利，河徙不相妨，已有明验。惟议者以祖陵为虑，请征往事折之。洪武二十四年，河决原武，东南至寿州入淮。永乐九年，河北入鱼台。未几复南决，由涡河经怀远入淮。时两河合流，历凤、泗以出清口，未闻为祖陵患。正统十三年，河北冲张秋。景泰中，徐有贞塞之，复由涡河入淮。弘治二年，河又北冲，白昂、刘大夏塞之，复南流，一由中牟至颍、寿，一由亳州至涡河入淮，一由宿迁小河口会泗。全河大势纵横颍、亳、凤、泗间，下溢符离、睢、宿，未闻为祖陵虑，亦不闻堤及归仁也。」
“运道通畅便利，黄河迁徙不相妨碍，已有明证。只是议论者以祖陵为虑，请征引往事来驳斥。洪武二十四年，黄河在原武决口，东南到寿州入淮。永乐九年，黄河向北流入鱼台。不久又向南决口，由涡河经怀远入淮。当时两河合流，经过凤阳、泗州出清口，没听说成为祖陵之患。正统十三年，黄河向北冲张秋。景泰年间，徐有贞堵塞它，又由涡河入淮。弘治二年，黄河又向北冲，白昂、刘大夏堵塞它，又向南流，一条由中牟到颍州、寿州，一条由亳州到涡河入淮，一条由宿迁小河口汇合泗水。全河大势纵横在颍州、亳州、凤阳、泗州之间，下流溢出符离、睢宁、宿迁，没听说为祖陵担忧，也没听说筑堤到归仁。”
正德三年后，河渐北徙，由小浮桥、飞云桥、谷亭三道入漕，尽趋徐、邳，出二洪，运道虽济，而泛溢实甚。嘉靖十一年，朱裳始有涡河一支中经凤阳祖陵未敢轻举之说。然当时犹时浚祥符之董盆口、宁陵之五里铺、荥泽之孙家渡、兰阳之赵皮寨，又或决睢州之地丘店、界牌口、野鸡冈，宁陵之杨村铺，俱入旧河，从亳、凤入淮，南流未绝，亦何尝为祖陵患？
正德三年以后，黄河逐渐向北迁移，从小浮桥、飞云桥、谷亭三条水道进入漕河，全部流向徐州、邳州，经过二洪，漕运虽然得到补给，但泛滥的情况非常严重。嘉靖十一年，朱裳才提出涡河一支流经凤阳祖陵，不敢轻举妄动的说法。然而当时仍然时常疏浚祥符的董盆口、宁陵的五里铺、荥泽的孙家渡、兰阳的赵皮寨，有时又在睢州的地丘店、界牌口、野鸡冈，宁陵的杨村铺决口，都流入旧河，从亳州、凤阳进入淮河，南流并未断绝，又何曾成为祖陵的祸患？
嘉靖二十五年后，南流故道始尽塞，或由秦沟入漕，或由浊河入漕。五十年来全河尽出徐、邳，夺泗入淮。而当事者方认客作主，日筑堤而窘之，以致河流日壅，淮不敌黄，退而内潴，遂贻盱、泗祖陵之患。此实由内水之停壅，不由外水之冲射也。万历七年，潘季驯始虑黄流倒灌小河、白洋等口，挟诸河水冲射祖陵，乃作归仁堤为保障计，复张大其说，谓祖陵命脉全赖此堤。习闻其说者，遂疑黄堌之决，下啮归仁，不知黄堌一决，下流易泄，必无上灌之虞。况今小河不日竣工，引河复归故道，云归仁益远，奚烦过计为？」报可。
嘉靖二十五年以后，南流的故道才完全堵塞，有的从秦沟进入漕河，有的从浊河进入漕河。五十年来，整个黄河都从徐州、邳州流出，夺取泗水河道进入淮河。而主事者却认客作主，每天筑堤来逼迫它，以致河流日益壅塞，淮河抵挡不住黄河，退而向内蓄积，于是给盱眙、泗州的祖陵带来祸患。这实际上是由于内水停滞壅塞，而不是由于外水冲击所致。万历七年，潘季驯才开始担心黄水倒灌小河、白洋等口，挟带各河水冲击祖陵，于是修筑归仁堤作为保障之计，又夸大其说法，认为祖陵的命脉全依赖这条堤坝。听惯这种说法的人，于是怀疑黄堌决口会向下侵蚀归仁，不知道黄堌一旦决口，下流容易宣泄，必定没有向上倒灌的忧虑。何况现在小河不久就要竣工，引河又回归故道，距离归仁更远，何必多此过虑呢？」奏报得到批准。
一魁既开小浮桥，筑义安山，浚小河口，引武沂泉济运。及是年四月，河复大决黄堌口，溢夏邑、永城，由宿州府离桥出宿迁新河口入大河，其半由徐州入旧河济运。上源水枯，而义安束水横坝复冲二十余丈，小浮桥水脉微细，二洪告涸，运道阻涩。一魁因议挑黄堌口迤上埽湾、淤嘴二处，且大挑其下李吉口北下浊河，救小浮桥上流数十里之涸。复上言：「黄河南旋至韩家道、盘岔河、丁家庄，俱岸阔百丈，深逾二丈，乃铜帮铁底故道也。至刘家ＡＨ，始强半南流，得山西坡、永涸湖以为壑，出溪口入符离河，亦故道也。惟徐、邳运道浅涸，所以首议开小浮桥，再加挑辟，必大为运道之利。乃欲自黄堌挽回全河，必须挑四百里淤高之河身，筑三百里南岸之长堤，不惟所费不赀，窃恐后患无已。」御史杨光训等亦议挑埽湾直渠，展济浊河，及筑山西坡归仁堤，与一魁合，独𫓧异议。帝命从一魁言。
一魁已经开通小浮桥，修筑义安山，疏浚小河口，引武沂泉水来补给漕运。到了这年四月，黄河又在黄堌口大决口，漫溢到夏邑、永城，从宿州府离桥流出宿迁新河口进入大河，其中一半从徐州进入旧河补给漕运。上游水源枯竭，而义安束水横坝又被冲开二十多丈，小浮桥的水流微弱，二洪宣告干涸，漕运通道阻塞不畅。一魁因此建议挑挖黄堌口上游的埽湾、淤嘴两处，并且大举挑挖其下游李吉口北下的浊河，以解救小浮桥上游数十里的干涸。又上奏说：「黄河南流回旋到韩家道、盘岔河、丁家庄，都是河岸宽达百丈，水深超过二丈，是铜帮铁底的故道。到刘家ＡＨ，才勉强大半南流，得到山西坡、永涸湖作为蓄水区，流出溪口进入符离河，也是故道。只有徐州、邳州的漕运水道浅而干涸，所以首先建议开通小浮桥，再加以挑挖开辟，必定大大有利于漕运。但要想从黄堌挽回整个黄河，必须挑挖四百里淤高的河床，修筑三百里南岸的长堤，不仅费用巨大，而且我担心后患无穷。」御史杨光训等也建议挑挖埽湾的直渠，扩展浊河，以及修筑山西坡归仁堤，与一魁的意见一致，只有𫓧持不同意见。皇帝命令听从一魁的建议。
一魁复言：「归仁在西北，泗州在东南，相距百九十里，中隔重冈叠嶂。且归仁之北有白洋河、朱家沟、周家沟、胡家沟、小河口泄入运河，势如建瓴，即无归仁，祖陵无足虑。浊河淤垫，高出地上，曹、单间阔一二百丈，深二三丈，尚不免横流，徐、邳间仅百丈，深止丈余，徐西有浅至二三尺者，而夏、永、韩家道口至符离，河阔深视曹、单，避高就下，水之本性，河流所弃，自古难复。且运河本籍山东诸泉，不资黄水，惟当仿正统间二洪南北口建闸之制，于镇口之下，大浮桥之上，吕梁之下洪，邳州之沙坊，各建石闸，节宣汶、泗，而以小浮桥、沂河口二水助之，更于镇口西筑坝截黄，开唐家口而注之龙沟，会小浮桥入运，以杜灌淤镇口之害，实万全计也。」报可。
一魁又说：「归仁在西北，泗州在东南，相距一百九十里，中间隔着重重山峦。而且归仁以北有白洋河、朱家沟、周家沟、胡家沟、小河口泄入运河，水势如从高处倾泻，即使没有归仁堤，祖陵也不足为虑。浊河淤积垫高，高出地面，曹县、单县之间河宽一二百丈，水深二三丈，尚且不免横流，徐州、邳州之间河宽仅百丈，水深只有一丈多，徐州西边有浅到二三尺的地方，而夏邑、永城、韩家道口到符离，河宽水深与曹县、单县相当，避开高处流向低处，是水的本性，河流所抛弃的河道，自古以来难以恢复。而且运河本来依赖山东各泉，不靠黄河水，只应当仿照正统年间二洪南北口建闸的制度，在镇口以下、大浮桥以上、吕梁的下洪、邳州的沙坊，各建石闸，调节宣泄汶水、泗水，并用小浮桥、沂河口两股水来辅助，再在镇口西边筑坝截断黄河，开通唐家口引水注入龙沟，汇合小浮桥进入运河，以杜绝灌淤镇口的危害，这实在是万全之策。」奏报得到批准。
二十六年春，从杨光训等议，撤𫓧，命一魁兼管漕运。六月，召一魁掌部事，命刘东星为工部侍郎，总理河漕。
万历二十六年春天，听从杨光训等人的建议，撤去𫓧的职务，命令一魁兼管漕运。六月，召一魁掌管部里事务，任命刘东星为工部侍郎，总管黄河和漕运。
二十七年春，东星上言：「河自商、虞而下，由丁家道口抵韩家道口、赵家圈、石将军庙、两河口，出小浮桥下二洪，乃贾鲁故道也。自元及我朝行之甚利。嘉靖三十七年北徙浊河，而此河遂淤。潘季驯议复开之，以工费浩繁而止。今河东决黄堌，由韩家道口至赵家圈百余里，冲刷成河，即季驯议复之故道也。由赵家圈至两河口，直接三仙台新渠，长仅四十里，募夫五万浚之，逾月当竣，而大挑运河，小挑浊河，俱可节省。惟李吉口故道尝挑复淤，去冬已挑数里，前功难弃，然至镇口三百里而遥，不若赵家圈至两河口四十里而近。况大浮桥已建闸蓄汶、泗之水，则镇口济运亦无藉黄流。」报可。十月，功成，加东星工部尚书，一魁及余官赏赉有差。
万历二十七年春天，东星上奏说：「黄河从商丘、虞城以下，由丁家道口到韩家道口、赵家圈、石将军庙、两河口，流出小浮桥下二洪，这是贾鲁故道。从元朝到本朝，运行起来非常有利。嘉靖三十七年向北迁移到浊河，这条河道就淤塞了。潘季驯建议重新开通它，但因工程费用浩大而停止。现在黄河向东在黄堌决口，从韩家道口到赵家圈一百多里，冲刷成河，这就是季驯建议恢复的故道。从赵家圈到两河口，直接连接三仙台新渠，长度只有四十里，招募五万民夫疏浚它，一个月内应当完工，而大举挑挖运河、小规模挑挖浊河，都可以节省。只有李吉口故道曾经挑挖后又淤塞，去年冬天已经挑挖了几里，前功难以放弃，但到镇口有三百里之远，不如赵家圈到两河口四十里这么近。何况大浮桥已经建闸蓄积汶水、泗水，那么镇口补给漕运也不必依赖黄河水。」奏报得到批准。十月，工程完成，加封东星为工部尚书，一魁及其他官员的赏赐各有差别。
初，给事中杨廷兰因黄堌之决，请开泇河，给事中杨应文亦主其说。既而直隶巡按御史佴祺复言之。东星既开赵家圈，复采众说，凿泇河，以地多沙石，工未就而东星病。河既南徙，李吉口淤淀日高，北流遂绝，而赵家圈亦日就淤塞，徐、邳间三百里，河水尺余，粮艘阻塞。
起初，给事中杨廷兰因黄堌决口，请求开通泇河，给事中杨应文也主张这个说法。不久直隶巡按御史佴祺又提出此事。东星开通赵家圈后，又采纳众人意见，开凿泇河，但因地方多沙石，工程未完成而东星病倒。黄河向南迁移后，李吉口淤积日益增高，北流于是断绝，而赵家圈也日渐淤塞，徐州、邳州之间三百里，河水只有一尺多深，运粮船只阻塞不通。
二十九年秋，工科给事中张问达疏论之。会开、归大水，河涨商丘，决萧家口，全河尽南注。河身变为平沙，商贾舟胶沙上。南岸蒙墙寺忽徙置北岸，商、虞多被淹没，河势尽趋东南，而黄堌断流。河南巡抚曾如春以闻，曰：「此河徙，非决也。」问达复言：「萧家口在黄堌上流，未有商舟不能行于萧家口而能行于黄堌以东者，运艘大可虑。」帝从其言，方命东星勘议，而东星卒矣。问达复言：「运道之坏，一因黄堌口之决，不早杜塞；更因并力泇河，以致赵家圈淤塞断流，河身日高，河水日浅，而萧家口遂决，全河奔溃入淮，势及陵寝。东星已逝，宜急补河臣，早定长策。」大学士沈一贯、给事中桂有根皆趣简河臣。
万历二十九年秋天，工科给事中张问达上疏议论此事。恰逢开封、归德发大水，黄河在商丘上涨，在萧家口决口，整个黄河都向南流注。河床变成平沙，商人的船只搁浅在沙上。南岸的蒙墙寺忽然迁移到北岸，商丘、虞城多被淹没，河势全部趋向东南，而黄堌断流。河南巡抚曾如春上报此事，说：「这是黄河改道，不是决口。」问达又说：「萧家口在黄堌上游，没有商船不能在萧家口航行而能在黄堌以东航行的，运粮船只大可忧虑。」皇帝听从他的话，正要命令东星勘察商议，而东星去世了。问达又说：「漕运通道的破坏，一是因为黄堌口的决口，没有及早堵塞；更因为全力投入泇河工程，以致赵家圈淤塞断流，河床日益增高，河水日益变浅，而萧家口于是决口，整个黄河奔溃流入淮河，势头危及陵寝。东星已去世，应赶紧补任河臣，及早制定长远之策。」大学士沈一贯、给事中桂有根都催促选拔河臣。
御史高举献三策。请浚黄堌口以下旧河，引黄水注之东，遂塞黄堌口，而遏其南，俟旧河冲刷深，则并塞新决之口。其二则请开泇河及胶莱河，而言河漕不宜并于一人，当选择分任其事。江北巡按御史吴崇礼则请自蒙墙寺西北黄河湾曲之所，开浚直河，引水东流。且浚李吉口至坚城集淤道三十余里，而尽塞黄堌以南决口，使河流尽归正漕。工部尚书一魁酌举崇礼之议，以开直河、塞黄堌口、浚淤道为正策，而以泇河为旁策，胶莱为备策。帝命急挑旧河，塞决口，且兼挑泇河以备用。下山东抚按勘视胶莱河。
御史高举献上三条策略。请求疏浚黄堌口以下的旧河，引黄河水向东注入，于是堵塞黄堌口，并遏制其向南，等旧河冲刷深了，就一并堵塞新决口。第二条策略是请求开通泇河和胶莱河，并说黄河和漕运不应由一人管理，应当选择人分别负责其事。江北巡按御史吴崇礼则请求从蒙墙寺西北黄河弯曲的地方，开凿疏浚直河，引水向东流。并且疏浚李吉口到坚城集淤塞的河道三十多里，而全部堵塞黄堌以南的决口，使河流全部回归正漕。工部尚书一魁斟酌采纳崇礼的建议，以开通直河、堵塞黄堌口、疏浚淤道为正策，而以泇河为旁策，胶莱河为备策。皇帝命令紧急挑挖旧河，堵塞决口，并且同时挑挖泇河以备使用。下诏让山东巡抚和巡按勘察胶莱河。
三十年春，一魁覆河抚如春疏言：「黄河势趋邳、宿，请筑汴堤自归德至灵、虹，以障南徙。且疏小河口，使黄流尽归之，则弥漫自消，祖陵可无患。」帝喜纳之。已而言者再疏攻一魁。帝以一魁不塞黄堌口，致冲祖陵，斥为民。复用崇礼议，分设河漕二臣，命如春为工部侍郎，总理河道。如春议开虞城王家口，挽全河东归，须费六十万。
万历三十年春天，一魁回复河抚如春的奏疏说：「黄河水势趋向邳州、宿迁，请求修筑汴堤从归德到灵璧、虹县，以阻挡南移。并且疏浚小河口，使黄水全部归入其中，那么泛滥自然消失，祖陵可以没有祸患。」皇帝高兴地采纳了。不久言官再次上疏攻击一魁。皇帝因一魁不堵塞黄堌口，导致冲击祖陵，将他贬为平民。又采用崇礼的建议，分设河臣和漕臣二人，任命如春为工部侍郎，总管河道。如春建议开通虞城王家口，挽回整个黄河向东流，需要费用六十万。
三十一年春，山东巡抚黄克缵言：「王家口为蒙墙上源，上流既达，则下流不可旁泄，宜遂塞蒙墙口。」从之。时蒙墙决口广八十余丈，如春所开新河未及其半，塞而注之，虑不任受。有献策者言：「河流既回，势若雷霆，藉其势冲之，浅者可深也。」如春遂令放水，水皆泥沙，流少缓，旋淤。夏四月，水暴涨，冲鱼、单、丰、沛间，如春以忧卒。乃命李化龙为工部侍郎，代其任。
万历三十一年春天，山东巡抚黄克缵说：「王家口是蒙墙的上源，上流既然通畅，那么下流就不能旁泄，应当随即堵塞蒙墙口。」皇帝听从了。当时蒙墙决口宽八十多丈，如春所开的新河还不到一半，堵塞后引水注入，担心承受不住。有人献策说：「河流既然回转，水势如雷霆，借助其水势冲击，浅的地方可以变深。」如春于是下令放水，水都是泥沙，水流稍微减缓，随即淤积。夏季四月，水暴涨，冲击鱼台、单县、丰县、沛县之间，如春因忧虑去世。于是任命李化龙为工部侍郎，代替他的职务。
给事中宋一韩言：「黄河故道已复，陵、运无虞。决口惧难塞，宜深浚坚城以上浅阻，而增筑徐、邳两岸，使下流有所容，则旧河可塞。」给事中孟成己言：「塞旧河急，而浚新河尤急。」化龙甫至，河大决单县苏家庄及曹县缕堤，又决沛县四铺口太行堤，灌昭阳湖，入夏镇，横冲运道。化龙议开泇河，属之邳州直河，以避河险。给事中侯庆远因言：「泇河成，则他工可徐图，第毋纵河入淮。淮利则洪泽水减，而陵自安矣。」
给事中宋一韩说：「黄河故道已经恢复，陵寝和漕运没有忧虑。决口恐怕难以堵塞，应当深挖坚城以上的浅阻之处，并增筑徐州、邳州两岸，使下流有容纳之处，那么旧河就可以堵塞。」给事中孟成己说：「堵塞旧河很紧急，而疏浚新河尤其紧急。」化龙刚到任，黄河在单县苏家庄和曹县缕堤大决口，又在沛县四铺口太行堤决口，灌入昭阳湖，进入夏镇，横冲漕运通道。化龙建议开通泇河，连接邳州直河，以避开黄河的危险。给事中侯庆远于是说：「泇河建成，那么其他工程可以慢慢谋划，只是不要放纵黄河进入淮河。淮河有利，那么洪泽湖的水就会减少，而陵寝自然就安全了。」
三十二年正月，部覆化龙疏，大略言：「河自归德而下，合运入海，其路有三：由兰阳道考城至李吉口，过坚城集，入六座楼，出茶城而向徐、邳，是名浊河，为中路；由曹、单经丰、沛，出飞云桥，泛昭阳湖，入龙塘，出秦沟而向徐、邳，是名银河，为北路；由潘家口过司家道口，至何家堤，经符离，道睢宁，入宿迁，出小河口入运，是名符离河，为南路。南路近陵，北路近运，惟中路既远于陵，且可济运，前河臣兴役未竣，而河形尚在。」因奏开泇有六善。帝从其议。
万历三十二年正月，部里回复化龙的奏疏，大致说：「黄河从归德以下，汇合漕运入海，其路径有三条：从兰阳经考城到李吉口，过坚城集，进入六座楼，出茶城而流向徐州、邳州，这叫浊河，是中路；从曹县、单县经丰县、沛县，出飞云桥，泛滥昭阳湖，进入龙塘，出秦沟而流向徐州、邳州，这叫银河，是北路；从潘家口过司家道口，到何家堤，经符离，经睢宁，进入宿迁，出小河口进入漕河，这叫符离河，是南路。南路靠近陵寝，北路靠近漕运，只有中路既远离陵寝，又可补给漕运，前任河臣兴工未完成，而河道形状还在。」于是上奏说开通泇河有六项好处。皇帝听从了他的建议。
工部尚书姚继可言：「黄河冲徙，河臣议于坚城集以上开渠引河，使下流疏通，复分六座楼、苑家楼二路杀其水势，既可移丰、沛之患，又不至沼砀山之城。开泇分黄，两工并举，乞速发帑以济。」允之。八月，化龙奏分水河成。事具《泇河志》中。加化龙太子少保兵部尚书。会化龙丁艰候代，命曹时聘为工部侍郎，总理河道。是秋，河决丰县，由昭阳湖穿李家港口，出镇口，上灌南阳，而单县决口复溃，鱼台、济宁间平地成湖。
工部尚书姚继可说：「黄河冲徙，河臣建议在坚城集以上开渠引河，使下流疏通，再分六座楼、苑家楼两路来削减水势，既可以转移丰县、沛县的祸患，又不至于淹没砀山城。开通泇河和分导黄河，两项工程同时进行，请求迅速拨发国库银两以接济。」皇帝批准了。八月，化龙上奏分水河建成。此事记载在《泇河志》中。加封化龙为太子少保兵部尚书。恰逢化龙因父母丧事等待替代，命令曹时聘为工部侍郎，总管河道。这年秋天，黄河在丰县决口，从昭阳湖穿过李家港口，流出镇口，向上灌入南阳，而单县决口再次溃决，鱼台、济宁之间平地变成湖泊。
三十三年春，化龙言：「丰之失，由巡守不严，单之失，由下埽不早，而皆由苏家庄之决。南直、山东相推诿，请各罚防河守臣。至年来缓堤防而急挑浚，堤坏水溢，不咎守堤之不力，惟委浚河之不深。夫河北岸自曹县以下无入张秋之路，南岸自虞城以下无入淮之路，惟由徐、邳达镇口为运道。故河北决曹、郓、丰、沛间，则由昭阳湖出李家口，而运道溢；南决虞、夏、徐、邳间，则由小河口及白洋河，而运道涸。今泇河既成，起直河至夏镇，与黄河隔绝，山东、直隶间，河不能制运道之命。独朱旺口以上，决单则单沼，决曹则曹鱼，及丰、沛、徐、邳、鱼、砀皆命悬一线堤防，何可缓也？至中州荆隆口、铜瓦厢皆入张秋之路，孙家渡、野鸡冈、蒙墙寺皆入淮之路，一不守，则北坏运，南犯陵，其害甚大。请西自开封，东至徐、邳，无不守之地，上自司道，下至府县，无不守之人，庶几可息河患。」乃敕时聘申饬焉。
万历三十三年春天，李化龙上奏说：“丰县的失事，是由于巡查防守不严；单县的失事，是由于下埽（一种护堤措施）不及时，而根本原因都在于苏家庄的决口。南直隶和山东互相推诿责任，请求分别处罚负责河防的官员。至于近年来，放松了堤防而急于挑挖疏浚，导致堤坝损坏、河水漫溢，不追究守堤不力的责任，只归咎于浚河不够深。黄河北岸从曹县以下没有流入张秋的通道，南岸从虞城以下没有流入淮河的通道，只有经过徐州、邳州到达镇口才是漕运通道。所以黄河在曹县、郓城、丰县、沛县之间向北决口，就会从昭阳湖经李家口流出，导致运道水满为患；在虞城、夏邑、徐州、邳州之间向南决口，就会从小河口和白洋河流出，导致运道干涸。如今泇河已经修成，从直河到夏镇，与黄河隔绝，山东、直隶之间，黄河不能再控制运道的命运了。只有朱旺口以上，如果单县决口，单县就会变成沼泽；曹县决口，曹县和鱼台就会遭殃，而丰县、沛县、徐州、邳州、鱼台、砀山都命悬一线于堤防，怎么能松懈呢？至于中州的荆隆口、铜瓦厢都是流入张秋的通道，孙家渡、野鸡冈、蒙墙寺都是流入淮河的通道，一旦失守，向北就会破坏漕运，向南就会侵犯皇陵，危害极大。请求西起开封，东到徐州、邳州，没有不防守的地方；上自司道官员，下到府县官吏，没有不防守的人员，这样或许可以平息河患。”于是皇帝下令让曹时聘认真执行。
其秋，时聘言：「自苏庄一决，全河北注者三年。初泛丰、沛，继沼单、鱼，陈灿之塞不成，南阳之堤尽坏。今且上灌全济，旁侵运道矣。臣亲诣曹、单，上视王家口新筑之坝，下视朱旺口北溃之流，知河之大可忧者三，而机之不可失者二。河决行堤，泛溢平地，昭阳日垫，下流日淤，水出李家口者日渐微缓，势不得不退而上溢。溢于南，则孙家渡、野鸡冈皆入淮故道，毋谓蒙墙已塞，而无忧于陵。溢于北，则芝麻庄、荆隆口皆入张秋故道，毋谓泇役已成，而无忧于运。且南之夏、商，北之曹、濮，其地益插，其祸益烈，其挽回益不易，毋谓灾止鱼、济，而无忧于民。顾自王家口以达朱旺，新导之河在焉。疏其下流以出小浮桥，则三百里长河畅流，机可乘者一。
这年秋天，曹时聘上奏说：“自从苏家庄决口，黄河全部向北流注已经三年。起初泛滥于丰县、沛县，接着淹没了单县、鱼台，陈灿堵塞决口没有成功，南阳的堤坝全部毁坏。如今河水向上淹灌了整个济宁，并向旁侧侵扰运道了。我亲自到曹县、单县，向上视察了王家口新筑的堤坝，向下视察了朱旺口向北溃决的水流，了解到黄河有三大令人担忧之处，以及两个不可错失的时机。黄河决口冲毁行堤，泛滥到平地上，昭阳湖日益淤垫，下游日益淤塞，从李家口流出的水日渐微弱缓慢，形势上不得不后退向上游漫溢。如果向南漫溢，那么孙家渡、野鸡冈都是流入淮河的故道，不要说蒙墙寺已经堵塞，就对皇陵没有担忧了。如果向北漫溢，那么芝麻庄、荆隆口都是流入张秋的故道，不要说泇河工程已经完成，就对漕运没有担忧了。况且南边的夏邑、商丘，北边的曹县、濮州，这些地方地势更加低洼，灾祸会更加严重，挽回也更加不容易，不要说灾害只限于鱼台、济宁，就对百姓没有担忧了。不过从王家口到朱旺口，新开凿的河道就在那里。疏浚它的下游，让水从小浮桥流出，那么三百里长的黄河就能畅通，这是第一个可以利用的时机。
自徐而下，清黄并行，沙随水刷，此数十年所未有，因而导水归徐，容受有地，机可乘者二。臣与诸臣熟计，河之中路有南北二支：北出浊河，尝再疏再壅；惟南出小浮桥，地形卑下，其势甚顺，度长三万丈有奇，估银八十万两。公诸虚耗，乞多方处给。」疏上留中。时聘乃大挑朱旺口。十一月兴工，用夫五十万。三十四年四月，工成，自朱旺达小浮桥延袤百七十里，渠广堤厚，河归故道。
从徐州往下，清水和黄河水并行，泥沙随着水流冲刷，这是几十年来没有过的现象，因此引导水流回归徐州，有地方容纳水量，这是第二个可以利用的时机。我与各位大臣仔细商议，黄河的中路有南北两条支流：北边流出浊河，曾经两次疏浚两次堵塞；只有南边流出小浮桥，地势低洼，水势很顺畅，估计长度有三万多丈，估算需要银两八十万。但国库空虚，请求多方筹措拨给。”奏疏呈上后留在宫中未批。曹时聘于是大规模挑挖朱旺口。十一月开工，动用民夫五十万人。万历三十四年四月，工程完成，从朱旺口到小浮桥绵延一百七十里，渠道宽阔堤坝厚实，黄河回到了故道。
六月，河决萧县郭暖楼人字口，北支至茶城、镇口。三十五年，决单县。三十九年六月，决徐州狼矢沟。四十年九月，决徐州三山，冲缕堤二百八十丈，遥堤百七十余丈，梨林铺以下二十里正河悉为平陆，邳、睢河水耗竭。总河都御史刘士忠开韩家坝外小渠引水，由是坝以东始通舟楫。四十二年，决灵璧陈铺。四十四年五月，复决狼矢沟，由蛤鳗、周柳诸湖入泇河，出直口，复与黄会。六月，决开封陶家店、张家湾，由会城大堤下陈留，入亳州涡河。四十七年九月，决阳武脾沙堽，由封丘、曹、单至考城，复入旧河。时朝政日驰，河臣奏报多不省。四十二年，刘士忠卒，总河阅三年不补。四十六年闰四月，始命工部侍郎王佐督河道。河防日以废坏，当事者不能有为。
六月，黄河在萧县郭暖楼人字口决口，北边的支流到达茶城、镇口。万历三十五年，在单县决口。三十九年六月，在徐州狼矢沟决口。四十年九月，在徐州三山决口，冲毁了缕堤二百八十丈，遥堤一百七十多丈，梨林铺以下二十里的正河全部变成了平地，邳州、睢宁的河水都干涸了。总河都御史刘士忠开挖了韩家坝外的小渠引水，从此坝以东才开始通航。四十二年，在灵璧陈铺决口。四十四年五月，又在狼矢沟决口，水流经蛤鳗湖、周柳湖等进入泇河，从直口流出，再次与黄河汇合。六月，在开封陶家店、张家湾决口，水流经会城大堤下到陈留，进入亳州的涡河。四十七年九月，在阳武脾沙堽决口，水流经封丘、曹县、单县到达考城，再次流入旧河。当时朝政日益松弛，河臣的奏报大多不被理会。四十二年，刘士忠去世，总河一职空缺了三年没有补任。四十六年闰四月，才任命工部侍郎王佐督管河道。河防日益废弛败坏，当政者无所作为。
天启元年，河决灵譬双沟、黄铺，由永姬湖出白洋、小河口，仍与黄会，故道湮涸。总河侍郎陈道亨役夫筑塞。时淮安霪雨连旬，黄、淮暴涨数尺，而山阳里外河及清河决口汇成巨浸，水灌淮城，民蚁城以居，舟行街市。久之始塞。三年，决徐州青田大龙口，徐、邳、灵、睢河并淤，吕梁城南隅隐，沙高平地丈许，双沟决口亦满，上下百五十里悉成平陆。四年六月，决徐州魁山堤，东北灌州城，城中水深一丈三尺，一自南门至云龙山西北大安桥入石狗湖，一由旧支河南流至邓二庄，历租沟东南以达小河，出白洋，仍与黄会。徐民苦淹溺，议集赀迁城。给事中陆文献上徐城不可迁六议。而势不得已，遂迁州治于云龙，河事置不讲矣。六年七月，河决淮安，逆入骆马湖，灌邳、宿。
天启元年，黄河在灵璧双沟、黄铺决口，水流经永姬湖从白洋河、小河口流出，仍然与黄河汇合，原来的河道淤塞干涸。总河侍郎陈道亨征调民夫筑堤堵塞。当时淮安连续几十天阴雨，黄河、淮河暴涨数尺，山阳的内外河以及清河的决口汇成一片汪洋，水灌入淮安城，百姓像蚂蚁一样聚集在城墙上居住，船只行驶在街市上。过了很久才堵住。三年，在徐州青田大龙口决口，徐州、邳州、灵璧、睢宁的河道都淤塞了，吕梁城的南角被淹没，沙土比平地高一丈多，双沟的决口也被填满，上下游一百五十里全部变成了平地。四年六月，在徐州魁山堤决口，水流向东北灌入州城，城中水深一丈三尺，一股从南门到云龙山西北大安桥流入石狗湖，一股由旧支河南流到邓二庄，经过租沟东南到达小河，从白洋河流出，仍然与黄河汇合。徐州百姓苦于水淹，商议筹集资金迁城。给事中陆文献上奏了徐州城不可迁移的六条理由。但形势所迫不得已，于是将州治迁到云龙山，河防事务就搁置不议了。六年七月，黄河在淮安决口，倒灌入骆马湖，淹灌了邳州、宿迁。
崇祯二年春，河决曹县十四铺口。四月，决睢宁，至七月中，城尽圮。总河侍郎李若星请迁城避之，而开邳州坝泄水入故道，且塞曹家口匙头湾，逼水北注，以减睢宁之患。从之。四年夏，河决原武湖村铺，又决封丘荆隆口，败曹县塔儿湾大行堤。六月黄、淮交涨，海口壅塞，河决建义诸口，下灌兴化、盐城，水深二丈，村落尽漂没。逡巡逾年，始议筑塞。兴工未几，伏秋水发，黄、淮奔注，兴、盐为壑，而海潮复逆冲，坏范公堤。军民及商灶户死者无算，少壮转徙，丐江、仪、通、泰间，盗贼千百啸聚。至六年，盐城民徐瑞等言其状。帝悯之，命议罚河曹官。而是时，总河朱光祚方议开高堰三闸。淮、扬在朝者合疏言：「建义诸口未塞，民田尽沉水底。三闸一开，高、宝诸邑荡为湖海，而漕粮盐课皆害矣。高堰建闸始于万历二十三年，未几全塞。今高堰日坏，方当急议修筑，可轻言开浚乎？」帝是其言，事遂寝。又从御史吴振缨请，修宿、宁上下西北旧堤，以捍归仁。七年二月，建义决口工成，赐督漕尚书杨一鹏、总河尚书刘荣嗣银币。
崇祯二年春天，黄河在曹县十四铺口决口。四月，在睢宁决口，到七月中旬，城墙全部倒塌。总河侍郎李若星请求迁城避灾，并开挖邳州坝泄水入故道，同时堵塞曹家口匙头湾，逼使水流向北注入，以减轻睢宁的灾患。皇帝听从了他的建议。四年夏天，黄河在原武湖村铺决口，又在封丘荆隆口决口，冲毁了曹县塔儿湾的大行堤。六月，黄河、淮河同时暴涨，海口淤塞，黄河在建义等口决口，向下淹灌兴化、盐城，水深二丈，村落全部被淹没。拖延了一年多，才开始商议筑堤堵塞。开工不久，伏天秋水暴涨，黄河、淮河奔涌注入，兴化、盐城成了水乡泽国，而海潮又逆流冲击，毁坏了范公堤。军民以及盐商、灶户死的人数不清，年轻力壮的流离失所，在江都、仪征、通州、泰州一带乞讨，成千上万的盗贼聚众啸聚。到六年，盐城百姓徐瑞等人上奏了情况。皇帝怜悯他们，命令商议处罚河曹官员。而这时，总河朱光祚正商议开挖高堰的三座闸门。淮安、扬州在朝中的官员联名上奏说：“建义等决口尚未堵塞，百姓的田地都沉在水底。三闸一开，高邮、宝应等城将荡为湖海，而漕粮和盐税都会受到损害。高堰建闸始于万历二十三年，不久就全部堵塞了。如今高堰日益损坏，正应当紧急商议修筑，怎么能轻易说开挖疏浚呢？”皇帝认为他们说得对，此事于是作罢。又听从了御史吴振缨的请求，修筑宿迁、宁陵上下西北的旧堤，以捍卫归仁。七年二月，建义决口的工程完成，皇帝赏赐督漕尚书杨一鹏、总河尚书刘荣嗣银两和布帛。
八年九月，荣嗣得罪。初，荣嗣以骆马湖运道溃淤，创挽河之议，起宿迁至徐州，别凿新河，分黄水注其中，以通漕运。计工二百余里，金钱五十万。而其所凿邳州上下，悉黄河故道，浚尺许，其下皆沙，挑掘成河，经宿沙落，河坎复平，如此者数四。迨引黄水入其中，波流迅急，沙随水下，率淤浅不可以舟。及漕舟将至，而骆马湖之溃决适平，舟人皆不愿由新河。荣嗣自往督之，欲绳以军法。有入者辄苦淤浅，弁卒多怨。巡漕御史倪于义劾其欺罔误工，南京给事中曹景参复重劾之，逮问，坐赃，父子皆瘐死。郎中胡琏分工独多，亦坐死。其后骆马湖复溃，舟行新河，无不思荣嗣功者。
崇祯八年九月，刘荣嗣获罪。起初，刘荣嗣因为骆马湖的运道溃决淤塞，提出了改河的倡议，从宿迁到徐州，另外开凿一条新河，分引黄河水注入其中，以通漕运。工程计划二百多里，花费金钱五十万。但他所开凿的邳州上下游，全是黄河故道，挖了一尺左右，下面都是沙子，挑掘成河后，过一夜沙子就落下来，河床又恢复平整，这样反复了多次。等到引黄河水进入其中，水流湍急，泥沙随水而下，大多淤积变浅，无法行船。等到漕船将要到来时，骆马湖的溃决正好平息，船夫都不愿意走新河。刘荣嗣亲自去督促，想用军法处置。有进入新河的船只总是苦于淤浅，官兵们多有怨言。巡漕御史倪于义弹劾他欺君罔上、延误工程，南京给事中曹景参又重重弹劾他，于是被逮捕审问，因贪赃罪，父子都死在狱中。郎中胡琏分工最多，也被处死。后来骆马湖再次溃决，船只行驶在新河上，没有人不怀念刘荣嗣的功劳。
当是时，河患日棘，而帝又重法惩下，李若星以修浚不力罢官，朱光祚以建义苏嘴决口逮系。六年之中，河臣三易。给事中王家彦尝切言之。光祚亦竟瘐死。而继荣嗣者周鼎修泇利运颇有功，在事五年，竟坐漕舟阻浅，用故决河防例，遣戍烟瘴。给事中沈胤培、刑部侍郎惠世扬、总河侍郎张国维各疏请宽之，乃获宥免云。
在这个时候，黄河的祸患日益严重，而皇帝又用严刑峻法惩罚下属，李若星因修浚不力被罢官，朱光祚因建义、苏嘴决口被逮捕入狱。六年之中，河臣换了三次。给事中王家彦曾恳切地指出这个问题。朱光祚也最终死在狱中。而接替刘荣嗣的周鼎，修治泇河、便利漕运很有功劳，任职五年，竟然因为漕船受阻于水浅，援引故意决坏河防的条例，被流放到烟瘴之地。给事中沈胤培、刑部侍郎惠世扬、总河侍郎张国维各自上疏请求宽恕他，才获得赦免。
十五年，流贼围开封久，守臣谋引黄河灌之。贼侦知，预为备。乘水涨，令其党决河灌城，民尽溺死。总河侍郎张国维方奉诏赴京，奏其状。山东巡抚王永吉上言：「黄河决汴城，直走睢阳，东南注鄢陵、鹿邑，必害亳、泗，侵祖陵，而邳、宿运河必涸。」帝令总河侍郎黄希宪急往捍御，希宪以身居济宁不能摄汴，请特设重臣督理。命工部侍郎周堪赓督修汴河。
崇祯十五年，流贼（指李自成起义军）围攻开封很久，守城官员谋划引黄河水淹灌他们。贼军侦察得知，预先做了防备。趁着水涨，贼军让他们的同党决开黄河淹灌开封城，百姓全部被淹死。总河侍郎张国维正奉诏赴京，上奏了情况。山东巡抚王永吉上言说：“黄河在汴城（开封）决口，水直冲睢阳，向东南注入鄢陵、鹿邑，必定会危害亳州、泗州，侵犯祖陵，而邳州、宿迁的运河必定干涸。”皇帝命令总河侍郎黄希宪急速前往捍卫抵御，黄希宪以自己身在济宁不能管辖汴州为由，请求专门设立重臣督理。于是命令工部侍郎周堪赓督修汴河。
十六年二月，堪赓上言：「河之决口有二：一为朱家寨，宽二里许，居河下流，水面宽而水势缓；一为马家口，宽一里余，居河上流，水势猛，深不可测。两口相距三十里，至汴堤之外，合为一流，决一大口，直冲汴城以去，而河之故道则涸为平地。怒涛千顷，工力难施，必广浚旧渠，远数十里，分杀水势，然后畚锸可措。顾筑浚并举，需夫三万。河北荒旱，兖西兵火，竭力以供，不满万人，河南万死一生之余，未审能应募否，是不得不借助于抚镇之兵也。」乃敕兵部速议，而令堪赓刻期兴工。至四月，塞朱家寨决口，修堤四百余丈。马家口工未就，忽冲东岸，诸埽尽漂没。堪赓请停东岸而专事西岸。帝令急竣工。
崇祯十六年二月，周堪赓上言说：“黄河的决口有两处：一处是朱家寨，宽约二里，位于黄河下游，水面宽阔而水势平缓；一处是马家口，宽一里多，位于黄河上游，水势凶猛，深不可测。两口相距三十里，到汴堤之外，合为一股水流，冲开一个大口子，直冲汴城而去，而黄河的故道则干涸成了平地。怒涛千顷，工程难以施展，必须广泛疏浚旧渠，延伸到数十里外，分散减弱水势，然后才能动用工具施工。但筑堤和疏浚同时进行，需要民夫三万人。河北地区荒旱，兖州西部遭受兵火，竭尽全力供应，也不满一万人，河南百姓在万死一生之余，不知道能否应募，这就不得不借助巡抚和总兵的军队了。”于是皇帝命令兵部迅速商议，并令周堪赓限期开工。到四月，堵塞了朱家寨决口，修筑堤坝四百多丈。马家口的工程尚未完成，忽然冲毁了东岸，所有埽（护堤材料）都被冲走。周堪赓请求停止东岸工程而专力修筑西岸。皇帝命令他尽快完工。
六月，堪赓言：「马家决口百二十丈，两岸皆筑四之一，中间七十余丈，水深流急，难以措手，请俟霜降后兴工。」已而言：「五月伏水大涨，故道沙滩壅涸者刷深数丈，河之大势尽归于东，运道已通，陵园无恙。」疏甫上，决口再溃。帝趣鸠工，未奏绩而明亡。
六月，周堪赓说：“马家决口宽一百二十丈，两岸都修筑了四分之一，中间七十多丈，水深流急，难以施工，请求等到霜降后再开工。”不久又说：“五月伏水大涨，原来淤塞干涸的故道沙滩被冲刷深达数丈，黄河的主流全部归于东边，运道已经畅通，陵园安然无恙。”奏疏刚呈上，决口再次溃决。皇帝催促聚集工匠，但工程尚未完工明朝就灭亡了。
卷八十三
卷八十三
卷八十五
卷八十五